请问，自然人股权转让，若是受让方提前预付部分股权转让款的，个人所得税纳税义务是否就发生了？

答复：

根据《国家税务总局关于发布<股权转让所得个人所得税管理办法（试行）>的公告》（国家税务总局公告2014年第67号）第二十条规定，个人股权转让中，若受让方已支付或部分支付股权转让价款，扣缴义务人、纳税人应当依法在次月15日内向主管税务机关申报纳税。

因此，提前预付部分股权转让款时，纳税义务即已发生，需按协议约定的转让总价计算应纳税所得额，而非按实际收款金额分期纳税。

参考：

广东省东莞市税务局在 2019 年的官方答复中明确：若股权转让协议已签订生效且受让方支付部分款项，即使剩余款项分期支付，纳税人仍需就全部股权转让所得一次性申报缴纳个人所得税，而非按实际收款进度分期缴纳。

因此：

股权转让款分期支付的，应在第一笔款项支付时按照全额申报缴纳个人所得税。