企业所得税的免税优惠是针对特定类型的收入本身（如自产自销农产品收入等）。只要该收入符合税法规定的免税条件，无论其对应的成本费用是否取得发票或是否进行纳税调增，该笔收入本身仍然属于免税收入。税务检查时不会因为成本费用未调增就否定该收入的免税资格。

注意：

企业所得税法明确规定，与免税收入直接相关的成本、费用、税金和损失，不得在计算应纳税所得额时扣除。

即使取得了合规发票，因为这些成本费用是用于产生免税收入的，税法也禁止其在应税所得中扣除。

如果税务局在检查中发现无票支出，税务局会要求你将这部分未调增的、与免税收入相关的无票成本费用（或者即使有票但属于免税收入对应的成本费用）重新调增回来，加到当年的应纳税所得额中。

总之：

免税资格不受影响：未对免税收入对应的无票成本费用进行纳税调增，不会导致该笔免税收入本身失去免税资格。该收入仍然免税。

建议：

对于免税收入对应的成本费用（无论是否有发票），在年度企业所得税汇算清缴时，必须在《纳税调整项目明细表》(A105000) 等相关表格中进行纳税调增处理。这是合规要求。