各省、自治区、直辖市、计划单列市财政厅(局)、环境保护厅(局)： 
　　为深化排污收费制度改革，进一步规范排污费的征收和使用，严格排污费“收支两条线”管理，促进环境保护部门依法行政，现就有关问题通知如下： 
　　一、各级财政部门和环境保护部门要严格执行《中共中央、国务院关于治理向企业乱收费、乱罚款和各种摊派等问题的决定》(中发[1997]14号)规定的收费项目审批制度，不得擅自设立排污收费项目、扩大收费范围、提高或降低收费标准。 
　　二、各级环境保护部门在征收排污费工作中，要严格执行国家有关法律、法规，坚持依法、全面、足额的征收原则，坚决杜绝人情收费、协商收费。 
　　三、排污费要全部纳入地方财政预算，实行“收支两条线”管理。严格实行“单位开票、银行代收、财政统管”的缴款方式。 
　　四、征收排污费一律使用省级财政部门统一监制的收费专用票据。排污费收费票据的具体管理、发放和监督使用办法，按省级财政部门的有关规定执行。 
　　五、排污费主要用于污染源治理和区域性污染防治，不得修建楼堂馆所，不得截留、挪用和私设小金库。 
　　六、各级环境保护部门的行政机关、环境监理机构、环境监测机构、环境科研机构和宣传教育机构的人员经费(包括基本工资、补助工资、职工福利费、住房公积金和社会保障费等)、公用经费(包括公务费、设备购置资和业务费等)、科研经费和专项经费，要全额纳入各级财政的年度经费预算。 
　　各级财政部门要结合本地区的实际情况，对环境保护部门正常工作运转所需经费予以必要保障。环境保护部门编制内的人员经费开支标准按照当地财政部门的有关规定执行；对环境保护部门开展环境监理和环境监测所需公用经费要给予重点保障；环境科研经费和专项经费要根据环境科研和业务工作的需要和地方财力可能，按照轻重缓急排序安排。 
　　七、各级财政部门和环境保护部门要进一步提高认识、加强领导、积极配合，全面落实“收支两条线”管理的各项规定，加强对排污费征收、管理和使用情况的监督检查。 
　　八、对管理混乱、问题突出的，要重点检查，限期整改。违反规定，擅自设立收费项目、改变收费范围和收费标准、下达或者变相下达收费指标、截留或挪用排污费的，要认真查实，依照有关法律、法规予以处罚。违反“收支两条线”管理规定的，要严格按照国务院关于《违反行政事业性收费和罚没收入收支两条线管理规定行政处分暂行规定》(国务院令第281号)，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员予以严肃处理。 
　　九、有关环境保护部门财政经费保障、排污费征收、管理、使用和监督等具体实施办法，由财政部会同国家环境保护总局另行制定。